Caracterización parcial fenotípica y del 16S rDNA de bacterias promotoras para el desarrollo vegetal

Abstract

Los microorganismos de suelo guardan una relación estrecha con las plantas, en particular las bacterias pueden auxiliar de manera simbiótica o no. El estudio de las bacterias promotoras en el crecimiento vegetal es limitado por lo que este trabajo pretende contribuir en el conocimiento de algunas característica fenotípicas y genotípicas de cepas bacterianas para el desarrollo vegetal. Se solicitaron dos cepas bacterianas crioconservadas de la Colección de Cultivos Bacterianos de FES-Iztacala UNAM para su análisis. Se realizó activación de las cepas, análisis fenotípico; morfología colonial, tinción de Gram, caracterización bioquímica: Oxidación¬Fermentación, Catalasa, Oxidasa e Indol, amplificación y secuenciación de la región 16S rDNA para analisis de BLAST en GenBank. Adicionalmente se uso como referencia DNA genómico de las cepas AAA1, SRA1 y RRJ1 caracterizadas por morfología y bioquímica previamente e identificadas como Pseudomonas sp. La cepa RH8530 fue identificada como Rhizobium tropici por pruebas tradicionales y similitud de 80% con Sinorhizobium meliloti. El análisis molecular determinó en dos DNA genomico de las cepas de referencia inconsistencia en su caracterización.

The soil microorganisms are closely related to the plants, in particular the bacteria can help in a symbiotic manner or not. The study ofthe promoter bacteria in plant growth is limited so this work aims to contribute to the knowledge of sorne phenotypic and genotypic characteristics of bacterial strains for plant development. Two cryopreserved bacterial strains were requested from the Bacterial Culture Collection of FES¬lztacala UNAM for analysis. Activation of the strains was performed, phenotypic analysis; Colonial morphology, Gram stain, biochemical characterization: Oxidation-Fermentation, Catalase, Oxidase and Indole, amplification and sequencing ofthe 16S rDNA region for BLAST analysis in GenBank. Additionally, DNA genomic of strains AAA1, SRA1 and RRJ1 characterized by morphology and biochemistry previously identified as Pseudomonas sp. Strain RH8530 was identified as Rhizobium tropici by traditional tests and similarity and 80% with Sinorhizobium meliloti. The molecular analysis determined in two DNA genomic strains of reference inconsistency in its characterization.