División de Ciencias Básicas e Ingeniería

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Catálogo de investigadores de las 5 Unidades de la Universidad Autónoma Metropolitana

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    A neural network modeling of the immunogenic activity of tumor derived peptides
    (Universidad Autónoma Metropolitana (México). Unidad Azcapotzalco. División de Ciencias Básicas e Ingeniería., 2015) Ordorica Vargas, Miguel Ángel; Velázquez Monroy, María de la Luz; Sánchez Barbosa, Sandra
    Los péptidos derivados de proteínas específicas de tumores pueden activar el sistema inmune contra las células tumorales. Para promover la respuesta inmune, los péptidos deben primero unirse a las moléculas del complejo principal de histocompatibilidad. Aunque algunas posiciones de la secuencia del péptido inmunogénico necesitan aminoácidos "ancla" específicos, el resto de los residuos también influye en la afinidad de la unión. Modelamos el efecto de la sustitución de aminoácidos, en la afinidad de unión de los péptidos utilizando una red neural artificial. La red predice correctamente la especificidad de las posiciones de anclaje, pero también sugiere que los aminoácidos con propiedades similares pueden ser incluidos en la secuencia de los péptidos con alta probabilidad de tener alta afinidad de unión.

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