Relación entre el número relativo de copias (de las CNVs esv3586400, esv27061 y esv2758781) y dislipidemias en población amerindia mexicana

Abstract

La dislipidemia se define como el conjunto de alteraciones en el perfil lipídico y son un factor de riesgo para enfermedades cardiovasculares, siendo estas últimas, la principal causa de muerte en México. La etiología de la dislipidemia es multifactorial; sin embargo, el factor genético juega un gran papel ya que hasta la fecha se han caracterizado más de 500 loci asociados a esta entidad. Dentro del genoma humano existen variantes, tanto de un solo nucleótido (SNV), como en el número de copias (CNVs), que se han evidenciado pueden contribuir con el riesgo/protección de enfermedades metabólicas. Debido a estos antecedentes, el objetivo de este trabajo fue correlacionar tres CNVs (esv3586400, esv27061 y esv2758781) con parámetros lipídicos en amerindios mexicanos. En relación a la CNV esv3586400 se encontraron dos individuos con una deleción en esta región. La mediana de copias relativas fue más elevada en personas con C-HDL normal (2.02 vs 1.54, p=<0.05). Además, esta CNV se correlacionó significativamente con el C-HDL (R= 0.2; p=0.02). En la CNV esv27061 se encontró un individuo con una duplicación, mientras que en la CNV esv2758781 8% de la población presentó ≥3CNVs. Ambas CNVs no demostraron asociación entre el número relativo de copias y dislipidemia, no obstante, la mayoría de los individuos con CNVs también presentaron un factor alterado del perfil lipídico. Las evidencias encontradas en este trabajo resaltan la importancia del estudio de las CNVs y su potencial efecto con dislipidemias.

Dyslipidemia is defined as the set of alterations in lipid profile and they are a risk factor to develop cardiovascular diseases, which are the primary cause of death in Mexico. The etiology of dyslipidemias is multifactorial; however, the genetic factor has a considerable influence in its development. Nowadays, there were characterized more than 500 loci associated with this disease. Within the human genome there are many types of variants, such as: SNVs (single nucleotide variations) or CNVs (copy number variations). Evidence suggests they are associated with the risk or protection to have metabolic diseases. The aim of this work was to find a correlation between three different CNVs (esv3586400, esv27061 and esv2758781) and lipid parameters in Mexican Amerindians. In the case of the CNV esv3586400, we found two individuals with deletions in this region. In this CNV, the relative copies median was higher in people who had normal serum cholesterol HDL than patients with low cholesterol HDL (2.02 vs 1.54, p=<0.05). In addition, this CNV showed a positive correlation with cholesterol HDL (R= 0.2; p=0.02). In the CNV esv27061, there was an individual with 3 copies; while, in the CNV esv2758781, 8% of population had more than 3 copies. Both CNVs did not show association between their relative number variation and dyslipidemia; nevertheless, the vast majority of people with CNVs either had an alteration in their lipid profile. Evidence showed in this work clearly remark the importance of keep studying CNVs and their potential effect on dyslipidemias.